南岳圣帝的来历有两种不同的观点，一种认为南岳圣帝是山神衍生出来的，没有具体的原身。另一种认为南岳圣帝有具体的原身。但原身是谁，意见也不一致。

地理学家认为，江南以衡山为镇，故封禅南岳神位，圣帝菩萨是总管南方的地方之神。星象学家认为，“南岳之镇曰衡”，“宿当翼轸，度应玑衡”，且轸星之旁有一小星曰长沙星，注生、主寿，因此南岳圣帝是天上派下来主宰人间生死寿命的天神。相传寿比南山不是陕西的终南山而是南岳衡山。以上的这些说法是主张圣帝菩萨没有原身的。

民间传说南岳圣帝是姜子牙封的，其原身是崇黑虎。这根据就是小说《封神演义》，不过,未免有点牵强臆造。

研究历史的文人和社会学家则以为，神都是由人演释出来的，南岳圣帝应是历史上为人类做过杰出贡献的伟人或伟大的氏族。而这位伟人或氏族是谁？现有资料也很难认定。

一种意见认为，南岳圣帝的原身是炎帝神农氏[是一个氏族首领还是一个氏族部落意见不一，我以为是一氏族部落]。按易经的五行学说南方属火，炎帝以火德王，是南方最大最强的一个氏族部落，也就是上古时期厉山国[今湖南属其地]的首领，按现在的说法他是南方的第一任长官，故称厉山氏。他对人类的贡献不容置疑，神农尝百草、教耒耕，应算是中国[可以说是人类]农业的创始人和水稻种植以及中草药的发明者。虽然他帝都长沙，葬在炎陵，但游息之所和主要活动在南岳衡山。且大南岳当时的概念也包括了长沙、炎陵乃至整个荆楚之地。从古至今，南岳的民间祭祀之盛，信众之广，渊源之长是其它四岳望尘莫及的。这一历史文化现象，仅用任何某种宗教信仰难以解释。追溯其源，我以为这不能排除有史以来人们对自己祖先炎帝的怀念和祭奠。

另一种意见认为南岳圣帝的原身是祝融。不过祝融也还有多个不同的概念：一个是祝融氏，另一个是祝融君，其实也都应是一个炎帝管辖的地方官职位。

其实，神也罢，菩萨也罢，都是人的杰作，是人们根据社会和自身的精神需求所创造的文化产物。也可以说是一种社会信仰寄托和积淀起来的文化现象。这种文化现象的产生，当然离不开一定的社会存在和客观物质基础。因为在人类较长的远古时期，五岳文化集中了民族文化的精髓，五岳文明代表了民族文明，若要天下太平，安抚百姓，必须打五岳的旗帜。对统治阶级而言，祭祀五岳、宣传五岳、建设五岳，也是一种政治需求，以图民安国富、鸿基永固。而普通百姓对岳神、对菩萨的信仰和崇拜，则是一种各自的精神需要，人们在复杂的社会生活和生产中，难免总会遇到各种各样的困难或困惑，也不可能对未来没有任何的企盼或寄望，因而就会想到只有威灵显赫的南岳圣帝才可以保佑自己。尽管这只不过是一种精神慰藉，但这种精神慰藉恰恰是人们心里欲望的满足。仍可以预言，不会因为科学的发展而致来南岳朝圣的人会越来越少。因为人类本身是一个怪物，越是古老的文化，越让人感兴趣。只不过朝圣祭祖的目的和方式会有所不同，可能会从科学与保护环境出发，趋向文明、简捷、研究、欣赏。
 

对于南岳大帝的来历，诸书记载不一。
《重修纬书集成》卷六《龙鱼河图》载：“南方衡山君神，姓丹名灵峙。南方霍山将军，姓朱名丹。一云衡山君烂洋光。”
《三教源流搜神大全》引东方朔《神异经》云：“南岳神姓崇，讳。”
《历代神仙通鉴》则认为伯益即南岳后身，为庆华注生真君，真君崇覃(金蝉长子)。
《封神演义》中则封崇黑虎为南岳衡山司天昭圣大帝。

——以上资料来源网络，准确性难鉴定。